Kur’an Eğitim Merkezleri, Diyanet İşleri Başkanlığı Kuruluş ve Görevleri Hakkında Kanun ile Devlet Memurları Kanununda ve 375 Sayılı Kanun Hükmünde Kararnamede Değişiklik Yapılmasını Öngören 7383 Sayılı Kanun ile 16/03/2022 tarihinde yasalaşmıştır. Başkanlığımızca yürütülmekte olan yaygın din eğitimi hizmetlerinin etkinlik ve verimliğinin daha da artırılması amacıyla 22/6/1965 tarihli ve 633 sayılı Diyanet İşleri Başkanlığı Kuruluş ve Görevleri Hakkında Kanunun 8 inci maddesinin üçüncü fıkrasına dayanılarak Kur'an Eğitim Merkezleri kurulmuştur. Bu bağlamda Kur’an Eğitim Merkezi Yönetmeliği 20 Nisan 2024 tarihinde Resmi Gazete’de yayınlanmıştır. Başkanlığımız ile Milli Eğitim Bakanlığı arasında 21 Mart 2024 tarihinde “Eğitimde İş Birliği Protokolü” imzalanmış ve söz konusu protokol 14 Mart 2025 tarihinde güncellenmiştir.